Les Hospitaliers avaient accumulé dans leur église une collection de reliques unique. L'inventaire qu'en a dressé, en 1710, le grand prieur de Toulouse, Pierre de Beaulac, comprenait :
- une fiole de lait de la Vierge
- un os du bras de saint Laurent
- du bois de la croix de Jésus-Christ
- du pain du miracle de la multiplication des pains
- du bois de la verge d'Aaron
- de la pierre de la table de la Cène
- un os du crâne et une dent de saint Jean Baptiste
- des ossements de sainte Madeleine
- du fer de la grille où saint Barthélemy
- deux petits bâtons de fer guérissant miraculeusement la rage des hommes et celle des bêtes.
